治療中はやはり妊娠してはいけないのでしょうか？

矯正治療そのものは薬を飲んだり注射をしたりしませんが、矯正治療開始前にはレントゲン写真を撮ったり抜歯が必要ならば注射もすることになると思います。ですから、その間をはずせば問題はありません。現時点で妊娠の可能性が確実にないのならば始めてもいいと思います。